После таяния ледника с гор стекало много воды, что способствовало акклиматизации, цветению и распространению нарцисса узколистого. Со временем на низменности от современного Мукачево до Хуста, где росли нарциссы, появились дубовые леса. После того, как на землях стали осуществлять хозяйственную деятельность, площадь долины нарциссов уменьшалась.
Во времена Австро-Венгрии урочище Киреши относилось к лесничеству и пристально охранялось. Было здесь много лекарственных растений, которыми местные медики лечили больных. Когда территория отошла к Чехословакии, часть этих земель продали жителям Хуста. Но тогдашние местные жители относились к природе с большим пониманием. Выпасать скот на заповедных землях им разрешалось до Юрия, а хозяйничать опять можно было только после 14 октября.
В советское время долину хотели перепахать, чтобы выращивать сельскохозяйственные культуры. В 1980-х гг. на территории заповедника осуществлялись осушительные работы, в результате которых существенно изменился растительный покров. После того, как было уничтожено 50 гектаров нарциссов, пахоту прекратили и передали территорию с нарциссами заповедному массиву Карпатского биосферного заповедника. Значительный личный взнос в дело сохранения и восстановления "Долины нарциссов" сделал профессор В.И. Комендар (который, собственно, и дал это название долине).